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低聚麦芽糖是淀粉经淀粉酶初级水解生成的产物，属于普通低聚糖。一、化学结构不同1、低聚麦芽糖：麦芽糖是两个葡萄糖分子以α一1，4糖苷键相联接双糖。
2、低聚异麦芽糖：异麦芽糖是两个葡萄糖分子以α一1，6糖苷键相联接双糖。二、特性不同1、低聚麦芽糖：具有易消化、低甜度、低渗透特性2、低聚异麦芽糖：低聚异麦芽糖糖浆为无色或浅黄色，透明粘稠液体，甜味柔和，无异味，无正常视力可见杂质。
糖粉为无定型粉末，甜味柔和，无异味，无正常视力可见杂质。三、作用1、低聚麦芽糖：对人体内有益的双歧杆菌有强大的增殖作用，净化肠道，促进肠蠕动，防止和解除便秘及腹泻，抑制体内有害菌的繁殖和有毒腐败物质的产生。
对分泌体内多种毒素的产气荚膜梭状芽胞杆菌有明显抑制作用，增强免疫力、降低胆固醇和血脂，促进老年人对钙质的吸收，是驻防老年人骨质疏松的有效营养补剂，还可阻断蔗糖被变异链球菌分解，抑制蛀牙。2、低聚异麦芽糖：低聚异麦芽糖有上述许多优良的性质和保健生理功能，适合代替部分蔗糖，添加到各种饮料、食品中。
还可作为畜肉加工品、水产制品、果酱油、蜂蜜加工品等的配料。
低聚异麦芽糖是以优质淀粉为原料提取，又被称为是异麦芽低聚糖，也是水溶性膳食纤维，热值低，是淀粉糖中的其中一种类型。低聚异麦芽糖属难发酵性糖，是酵母和乳酸菌不能利用的糖类。添加到食品中不会过多的增加食品的热值。
低聚异麦芽糖又被称为是异麦芽低聚糖，是淀粉糖中的其中一种类型。 低聚异麦芽糖对人体是有很大的好处的，低聚异麦芽糖和其他的糖相比也不会特别甜，在饮料中会添加低聚异麦芽糖是因为低聚异麦芽糖会比较耐热也比较耐酸，除此之外还有具有一些发酵性。
淀粉糖的一种：
自然界中低聚异麦芽糖极少以游离状态存在，但作为支链淀粉或多糖的组成部分，在某些发酵食品如酱油、黄酒或酶法葡萄糖浆中有少量存在。工业上以淀粉为原料生产低聚异麦芽糖需要一种酶，此酶为α-葡萄糖苷酶，又名葡萄糖基转移酶，简称α-糖苷酶。它能切开麦芽糖和麦芽低聚糖分子结构中α-1，6糖苷键，并能将游离出来的一个葡萄糖残基转移到另一个葡萄糖分子或麦芽糖或麦芽三糖等分子中的α-1，6位上，形成异麦芽糖、异麦芽三糖、异麦芽四糖、异麦芽五糖和潘糖等。
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低聚异麦芽糖在自然界中极少以游离的状态存在，现在的低聚异麦芽糖大多是人工合成的，它在人体的养生保健以及食品应用方面用的都比较多。
低聚异麦芽糖本身来说耐热、耐酸对于人体来说是具有一定好处的，像低聚异麦芽糖广泛的用于食品加工，对于人体来说可以提高像是乳制品的消化率、提高耐乳糖性。
另外，对于防止龋齿也有一定的效果，因此所以广泛的用于食品加工业。
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