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其实畸胎瘤主要源于胚胎多胚层组织的肿瘤，但是发生于咽部者少见，基本上是位于鼻咽部，相比较女性多于男性，大多数为良性肿瘤。病因未明，有可能是发源于多胚层组织的真性肿瘤，但是也会认为胚胎时部分细胞脱离了整体的影响，呈杂乱分化和过度繁殖而形成的，
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