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巴西龟的公母分辨主要有三点：
1.前爪：公的长，母的短。
2.尾巴：公的粗长，母的短。
3.泄殖孔：公的在肛盾外侧，母的在肛盾内侧。
对于大多数种类的同年的成年龟，雄龟体形较薄而小；雌龟体形圆厚且大。而具体的性别辨别方法为：
1）排泄孔位置及形状可分辨出雌雄： 公龟的位置接近尾端，孔形长形。 母龟的位置接近腹甲，孔形圆形。
2）尾部的粗细大小，公龟尾较粗大，母龟较细短。
3）甲是否凹陷，公龟有明显的凹陷， 母龟平坦。
4）注意雄性乌龟成熟后全身变成黑色，而雌性乌龟则还是原来棕褐色体色。
5）雄龟腹部的花纹稀疏，而雌龟腹部的花纹密集。
6）雄性个体重不超过500克，四肢的爪较长，雌性个体重达可达1000～2000克，但其指甲会较公龟来的短。
区分巴西龟公母方法，具体如下：
1、看尾巴。雄性乌龟：尾巴很长，并且基部很粗大，形成一个锐角三角形。雌性乌龟：尾巴较短，并且基部细小，形成条状。2、看泄殖孔。雄性乌龟：泄殖空在尾巴上，距离腹甲后缘较远，孔成长形。雌性乌龟：泄殖空在尾巴上，距离腹甲后缘较近，孔成圆形。
3、看腹甲。雄性乌龟：腹甲中央略微向内凹陷。雌性乌龟：腹甲中央平坦无凹陷
4、看有没有生殖器。雄性乌龟：用手指按压龟四肢使其不能伸出，它的生殖器会从生殖孔中伸出
雌性乌龟：同样的方法，泄殖孔分泌出液体，即为雌龟。
5、看体重花纹。大部分情况下，即便是成熟了的母龟，体重也是在500克一下的，腹部花纹比较稀疏，背甲颜色变为黑色。而公龟的体重在成熟之后达到1000-2000克，腹部花纹密集，背甲颜色不会有大的变化，仍然是之前的颜色。
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